Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RORAP35398 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RORAP35398 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RORAP35398 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORAP35398 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORAP35398 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORAP35398 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORAP35398 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORAP35398 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RORAP35398 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms