Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA6P31267 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms