Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms