Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms