Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMBRP28336 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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