Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPREP23469 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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