Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD53P19397 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD53P19397 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms