Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF3P18847 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF3P18847 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms