Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DESP17661 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DESP17661 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DESP17661 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms