Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms