Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI2P10070 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI2P10070 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI2P10070 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms