Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms