Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4BP0C0L5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4BP0C0L5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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