Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI1P08151 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GLI1P08151 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GLI1P08151 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms