Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHOP08100 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHOP08100 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RHOP08100 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms