Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GJB1P08034 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJB1P08034 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB1P08034 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB1P08034 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB1P08034 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB1P08034 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJB1P08034 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJB1P08034 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms