Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLK3P07288 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLK3P07288 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms