Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCTN3O75935 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms