Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCAO15360 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FANCAO15360 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FANCAO15360 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FANCAO15360 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms