Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHMG1C9JSJ3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms