Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4E171 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4E171 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
B4E171 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms