Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC4Q9Y296 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms