Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAK1Q9UPV9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAK1Q9UPV9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms