Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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