Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms