Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDE1Q9NZC3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDE1Q9NZC3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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