Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms