Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A1Q9NY26 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A1Q9NY26 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms