Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms