Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-5Q9HDB9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms