Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRA1Q9HD15 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms