Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5DQ9BY66 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms