Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC4A5Q9BY07 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms