Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCD2Q9BXW9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms