Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms