Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LPIN3Q9BQK8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms