Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT140Q96RY7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms