Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPUSD4Q96CM3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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