Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC1Q96C34 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms