Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms