Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD53Q8N9V6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms