Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HERC6Q8IVU3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms