Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRRT2Q7Z6L0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms