Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTF1AQ7RTS3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms