Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCD1Q6ZMY3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms