Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF7Q6Q0C0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms