Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRNP1Q6NT89 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms