Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEF20Q5VT98 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms