Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEXMIFQ5QGS0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEXMIFQ5QGS0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms