Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UPP1Q16831 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UPP1Q16831 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms